La Pinacoteca es una colección de alrededor de 400 obras de artistas argentinos de diferentes épocas, representantes de diversas corrientes artísticas.

El origen de esta colección de grandes obras pictóricas está vinculado al Museo de la escuela Fernando Fader, cuyo director, Sixto Clara, estaba firmemente convencido de la importancia del arte como medio de enseñanza. Las obras donadas, junto a las de otros museos escolares, se integraron primero al Consejo Nacional de Educación para pasar finalmente a nuestro ministerio.

La colección cuenta con tres núcleos: Histórico, que comprende obras de la primera mitad del siglo XX que nos muestran distintos aspectos de la vida argentina como trabajo, intimidad, ocio, campo y vida urbana; Gabinete de estampas, donado por la Academia Nacional de Bellas Artes; y Contemporáneo, resultado de la donación de artistas y coleccionistas privados.